所定が10:00~15:00のパート社員の勤務区分を作成し、10:00~15:30で打刻したところ、残業時間30分が反映されません。

A.

勤務区分の設定に誤りがある可能性がございます。
10:00~15:00のパート社員の勤務区分の設定で「法定内時間外労働時間：含める」になっているかを確認してください。含めないとなっている場合は含めるに変更することで、所定労働時間を超えて法定労働時間以内に行った残業時間が集計されます。